本地質図の東部には 渡島 半島が，西部には水深3,700 mに達する日本海盆が広がり，その間を南北に伸びる奥尻海嶺が貫く．奥尻島は本地質図南部の奥尻海嶺上に位置する．奥尻海嶺と渡島半島の間の低地は，北部では 後志 舟状海盆の南部を含み水深は3,300 mを超えるが，奥尻島と渡島半島の間の奥尻海峡では水深600 mより浅く，南部の奥尻海盆北部では水深900 mに達する．奥尻島北西方と 茂津多 岬 西方沖の斜面は3,000 m以上の比高を持つ急斜面で，大規模な地滑りが生じたことを示唆する崖地形が観察できる．奥尻島北西方沖から東方沖の海底には，稲穂海丘，滝ノ澗海丘，沖ノ根など、北西―南東方向に並ぶ火山性のマウンドが分布する．