地質標本館は、2010年9月まで広報部の所属でしたが、2010年10月の組織改変により、地質分野の一組織となりました。現在、以下の3つのグループによる運営体制となっています。

　地質標本館は、産業技術総合研究所地質分野の研究成果の普及活動を行い、あわせて研究によって収集された地質試料の整備・管理と試料調製による研究支援を行っていきます。

【地質標本館の組織】

　以下の３つのグループが地質標本館の活動を推進していきます。

１．企画運営グループ

• 館施設・業務の一体管理
• 地質標本館の館内での展示や行事、地域センターへの移動展示などの企画・調整・運営
• ジオパーク、ジオネットワークつくば、地質の日事業、地質情報展など、産総研地質分野を代表して外部機関との連携をとりながら行うアウトリーチを推進
• 「地質相談所」を窓口として、所内外からのさまざまな階層の地質相談業務に対応
• GSJ地質ニュースの編集・発行

２．地質試料管理グループ

• 地質試料の整備、管理・保管、登録・利用支援、アーカイブ、DB化
• 地質標本に関わる研究

３．地質試料調製グループ

• 地質試料の調製業務（薄片・研磨片など）
• 泥弱質試料等の試料調製技術開発

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